El tratamiento consiste en la eliminación de la pulpa afectada de los conductos radiculares para eliminar las bacterias existentes, a continuación se rellenan con materiales termoplásticos y cementos que aseguran el sellado de los conductos para evitar nuevas afectaciones. Finalmente, con la reconstrucción del diente recuperará la estética y la función masticatoria de la pieza tratada.
Hay casos en los que la caries lleva mucho tiempo afectando al nervio, provocando una infección crónica radicular, cuanto más tiempo pase en realizarse el tratamiento endodóntico, peor pronóstico.